在刚刚结束的第19届国际十字花科植物遗传学研讨会暨芸薹属2014年年会上，一篇来自浙江大学的大会报告吸引了与会专家学者的广泛关注并引发了热烈讨论。这篇题为《Genome Sequencing of Chinese vegetable Brassica juncea（中国传统蔬菜：芥菜基因组测序成果）》的报告，全面介绍了芥菜基因组测序组装阶段性成果，标志着基因组测序多年来的一个技术壁垒——四倍体基因组测序组装难题被成功攻破。

十字花科是蔬菜中最重要的一科，种类繁多且种植广泛，营养丰富，被誉为“抗癌天使”，如白菜、甘蓝、芥菜、萝卜等；同时十字花科也是油料作物中非常重要的一科，如油菜就是重要的食用油来源。十字花科的生物多样性极高，种类繁多，而芥菜就是十字花科中的四倍体代表作物。芥菜为同属白菜和黑芥杂交多倍化的产物，是一种在亚洲普遍食用的蔬菜品种。芥菜浑身是宝，根茎叶花籽都可食用，平时吃的芥菜疙瘩、涪陵榨菜、芥末，都来自这个物种，庆丰包子铺的“主席套餐”中就有芥菜。

因此解读芥菜基因组有非常重要的意义：一是从基因组层面揭示十字花科中多倍体的变化机理，解释多倍化对物种多样性的贡献；二是从基因层次解读十字花科营养学等经济性状的奥秘，为蔬菜的育种提供重要的依据。

然而多倍体中因为存在多套相似的基因组，所以一直面临策略设计难，费用高昂，组装质量低下的挑战。此次北京百迈客生物科技有限公司联手浙江大学和中国农科院，共同开发新技术，从生物信息学角度攻克了四倍体组装中难以区分多倍体序列来源的难题，使得我们可以利用成本较低的全基因组鸟枪法测序策略实现了四倍体芥菜的基因组测序组装，并建立了一套四倍体测序的标准和校正四倍体测序结果的技术。此项研究填补了国内在此项技术上的空白，达到了世界领先水平。

国外专家正在观看芥菜基因组组装成果

背景介绍：北京百迈客生物科技有限公司成立于2009年，是一家从事高通量测序技术和生物信息技术服务的企业。公司拥有先进的高通量测序平台，业务发展迅速，已荣获多项基因测序方面专利，2013年被评为“德勤高科技、高成长亚太500强企业”。